يعمل مركز بحوث الصحراء بالتعاون مع الجهات الدولية على تنمية الوديان الجافة في الساحل الشمالي الغربي لمصر وشمال سيناء، حيث نجح المركز مؤخرا في تنمية عدد كبير من الوديان وحفر أكثر من 10 آلاف بئر.

بالإضافة إلى تطهير ورفع كفاءة أكثر من 800 بئر روماني قديم، بسعات كبيرة منتشرة في الصحراء، كانت تستخدم خلال العصر الرومانيفي حصاد وتخزين مياه الأمطار. وشهدت السنوات الأخيرة، اهتماماً كبيراً بإنشاء مئات السدود بالوديان لحجز مياه الأمطار وتخفيف سرعة انجرافها نحو البحر واستغلالها في زراعة أكثر من 150 ألف فدان.